DNA与蛋白质相互作用结构特征.docx

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1、及蛋白质相互作用的结构特征7反式作用因子必需及眼式作用元件相结合，才能发挥其调整基因表达的作用。反式作用因子至少含有三个功能域，即结合功能域，转录活性功能域和其它转录因子结合功能域。反式作用因子的结合功能域具有些带共性的结构特征，犹如源结构域、碱性亮氨酸拉链模体、锌指模体等。1. 旋-转角-螺旋模体（O）1.1 原核生物模体（）色氨酸阻遏因子和分解产物基因激活蛋白O均为同二聚体，分子结构中含模体，该模体由两段螺旋和一段B-转角构成（但须要另外伸出的第三个-螺旋才能稳定），其次个-螺旋负责识别大沟序列，故称为识别螺旋（图103）图103模体的分子结构1031.2 真核生物模体（）同源异型结构域。

2、同源异型结构域的氨基酸残基序列及原核细胞类似，由三段螺旋，环绕一个疏水核心折叠而成。所不同的是识别螺旋较长，在大沟中的定向有所不同，其典型的结合位点是盒（图104）。图104同源异型结构域的分子结构104模体（）为模体的变体，其结构类似r同源结构域，但其B-转角由5个残基构成,识别螺旋及有较长的接触面（图105）图105模体的分子结构1051.2.3 侧翼模体（）侧翼模体是Q/B变体，由UO个保守的氨基酸残基构成B识别螺旋,另外两个翼状环结构及相邻的骨架和小沟相互作用。典型的例子是肝细胞核因子-3(3)(图106)图106侧翼模体的分子结构106分解产物基因激活蛋白样结构域()其核生物多种转录

3、激活因子均具有此结合结构域，但及不同，该结构域是以集体形式及大沟结合，其结合靠水介导。典型的例子如转录因子.1的结构域(图107)图107转录因子.1的结构域107.11.2.5 P结构域()该结构域由15夕162个氨基酸残基组成，有两个独立的球状结构域：和。位于的的端，含多个Q-螺旋。两个球状结构域分别位于双螺旋两侧大沟内，识别53八聚碱基序列。其中，结合5端序列，而结合3端序列。典型的例子包括1，1、2、4等（图108）。图1081和1中的结构域10811成对结构域（）由两个球形亚结构域组成，及两个同源异型结构域相像，但不同于，仅端的亚结构域为大沟的识别螺旋。该结构域见于蛋白（）（图109

4、）。2.碱性亮氨酸拉链模体（）2.1 磁性区/亮氨酸拉锥（,）该模体的末端垂且序列形成左手卷曲撼旋，每间隔7个残基出现一个亮氨酸，故称之为亮氨酸拉链。模体的末端富含碱性氨基酸残基（碱性区），及的大沟特异性结合。常见的反式作用因子有：、4等，它们通常以同二聚体或异二聚体的形式及结合（图110）。图IlO碱性区/亮氨酸拉链模体的分子结构1102. 2碱性区/螺旋-环-螺旋/亮氨酸拉雒（,）该模体由60100个保守的氨基酸残基构成，末端为15个残基组成的碱性区，紧随两个-螺旋（中间为环区）。末端碱性区至第一个-螺旋段为特异序列结合域。常见的反式作用因子有:，E12,E47,1（g11l）.图Ill碱

5、性区/螺旋-环-螺旋/亮氨酸拉链模体的分子结构Ill3. 锌指模体（）3.2 C2H2型锌指（C2H2）由约30个氨基酸残基组成，序列特征为：2-5122-5。由12个残其构成的螺旋，匏2及相对的折段结构相连。其连续存在的锌指模体识别螺旋位于的大沟（图112114）。图112C2H2型锌指模型112C2H2图113小鼠268中的C2H2型锌指模体113C2II2268图114爪螭HlA中的C2H2型锌指模体114C2H2IIIA3.3 C4型核受体（C4）C4型核受体锌指由7080个氨基酸残基构成，其中包含两个串联的锌指模体变体：两个模体之为识别螺旋，另个模体则是不规则的环。C4图117和中的

6、C4型锌指模体117C4锌指模体超家族的成员总结如表6。表6锌指模体超家族6IMMWMettanmmJrnwCWMurtHi皿FONMmIrmMiMNOfWVWWlm3K“Iln”!RmvMIFKrtnie-malm2r“mW-nl三wrmuHUCj1110OMACphOlWVMHwfWMrvIrMnuk-I.W-mIUnGOrCwjw1m，OlfI.M*tM4MC*Cswm)l,-i.MMMM5-utihb-0MMMAmwnm.MkMtoti0OMA、rnooM)口付K3rr,-mIWingBWJ.MOM)IVWYBAAMMtMecMMnCRAIr38M1lWAFAmj0MMngOMAi.M

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9、形式及相结合（图118）。图H84中的双核锌簇模体5. “澳”结构域O在很多OlOO种）转录因子或转录共激活/共阻遏因子中存在的螺旋束样的结构域，称为“澳”结构域.“溪”结构域可特异性识别组蛋白的乙酰化赖氨酸残基，故具有“溟”结构域的蛋白质/摄通常及组蛋白的乙饿化-去乙酰化修饰作用相关（图119121）.TMnmbrlTA7X2S0br2=rCalP/CKF9SnmnQ1.Y9TU6X1.gVKSgBK*fHBE3ETMQ工YSVXJttm1.KM8SUMyOCMS124MOIUlOFMMMQtH98SGUAA”VllQVemVKrYYprXUm9NVX3I-3hGCW$343CKBUOQOQ

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11、TA7XI2S0-brlX4“XRXaTSRBBFJUMUXXVXraATm0,KWQXSQCM1.oICDK1.KKCB143TATX2S0-br21559KXKTQSRBSF1.CoVmuKSVKPSSEXnBIVmnrET11xwMTranc*orUM*4,600PromMae(1.000ta*MM图122大肠杆菌中。因子对基因表达的调控E.122Mycoplasmasp.1AquifeGtolicus4EschenchiacoH7BacillusSubtHis18Pscudomonasaenjgmosa24Streptoncesccclicolor63.accordingtothecomplexityoftheirenvironment图123在不同细菌中。因子的数目不同123阻遏因子O阻遏因子及其特异的操作子元件（0识别、结合并阻断转录过程，如阻遏因子。1.2.3激活因子。